Как написать в службу поддержки Яндекс? Например, по поводу АГС.

Как проверить сайт на АГС и написать в службу поддержки Яндекс?

Зачем писать? Чтобы сняли АГС, конечно же. Напишите, что все "косяки" вы исправили и просите снять санкции с сайта.

Перед этим уберите всю рекламу, все внешние ссылки, наполните сайт уникальной информацией.

Проверить сайт на АГС Яндекса можно по ссылке https://yaca.yandex.by/yca/cy/ch/site.ru  - убрать site.ru и поставить свой домен.

УСПЕХОВ!